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新 名偵探柯南 VOL.1
◎崛田三兄弟殺人事件
◎敷面膜殺人事件
◎雪山山莊殺人事件
師生間的恩怨情仇……
毛利小五郎一家人到山上滑雪度假，在大雪紛飛的夜裡某大學教授在豪華別墅中慘遭殺害，同時在別墅中度假的人竟全是教授的學生，到底哪一個學生是兇手？ 一段師生間不為人知的愛恨糾葛、恩怨情仇，真相緩緩浮出……
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新 名偵探柯南 VOL.2
◎健身俱樂部殺人事件
◎外交官殺人事件（上）
◎外交官殺人事件（下）
江戶川柯南變回工藤新一的解藥……
外交官官邸發生離奇的密室殺人事件；有關東地區"工藤新一"之稱的服部平次利用此事件想與新一一較高下，到底誰的偵探推理能力較強呢？工藤新一的及時出現能為錯綜複雜、毫無頭緒的案情提供解答嗎？好戲正在上演，請大家拭目以待……
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新 名偵探柯南 VOL.3
◎圖書館殺人事件
◎高爾夫練習場殺人事件
◎神秘凶器殺人事件
圖書館中的殺人魔王……
入夜後的圖書館一片寂靜，昏暗的走道盡頭，傳來一陣陣陰險的竊笑聲還有腳步聲，不斷的迴響著，是鬼魂在作怪嗎？充滿詭譎的圖書館中到底隱藏什麼秘密？ 少年偵探團在調查失蹤案件時，無意中發現圖書館管長得陰謀，正準備揭發其罪行竟遭到追殺，在孤立無緣的情況下，科南一行人能平安脫險嗎？
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新 名偵探柯南 VOL.4
◎電玩公司殺人事件
◎列車手法殺人事件
◎清潔車殺人事件
神秘組織的現身……
電玩軟體公司召開遊戲軟體發表會，熱鬧的會場突然發生爆炸，並且有人當場遇害，科南親眼目睹爆炸過程，卻無意間發現追查已久的秘密組織成員也涉案其中；滿目瘡痍的會場，煙霧瀰漫，科南能撥開迷霧查出真相嗎？
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新 名偵探柯南 VOL.5
◎荷姆斯福利克殺人事件（上）
◎荷姆斯福利克殺人事件（下）
◎第一次購物殺人事件
危機四伏的偵探團之旅……
柯南、小蘭、毛利小五郎參加偵探小說迷旅行團，同行的其他成員皆是偵探推理高手，一行人到達下榻的別墅後，卻接連發生兩起離奇的命案，由於犯案技巧非常高明，令在場的人毫無頭緒，雖然案情疑雲籠罩，但是科南卻已經看出破綻……
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新 名偵探柯南 VOL.6
◎插畫畫家殺人事件
◎幽靈船殺人事件（上）
◎幽靈船殺人事件（下）
幽靈船上的黃金傳說……
毛利小五郎受邀至某個小島上演講，並接受村長委託尋找多年前因載運黃金遇暴風雨而沈沒的船隻，小五郎接受委託後，竟接連遭到暗殺，科南看出幕後的陰謀，積極展開調查，追查真相，卻引來殺身之禍，命在旦夕的科南能化解危機嗎？
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新 名偵探柯南 VOL.7
◎霧天狗傳說殺人事件（上）
◎霧天狗傳說殺人事件（下）
傳說中的妖怪--霧天狗
柯南、小蘭與毛利小五郎一起去賞櫻花，卻因故借宿在一間寺廟裡；寂靜的寺廟中，傳說有妖怪--霧天狗出沒，果然廟寺的住持，隔天被發現吊死於房間中，由於死亡的方式非一般兇手所能做到，更使整個案情陷入迷霧；古老的傳說加上鬼怪懸疑的寺廟，其中到底有何不為人知的秘密……
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新 名偵探柯南 VOL.8
◎第三個指紋殺人事件
◎螃蟹與鯨魚綁架事件
◎夜路殺人事件
與黑道掛勾的刑警……
一起看似意外的死亡事件，背後卻隱藏醜陋的內幕；科南在偵察一件刑警辦案的意外誤殺事件時，發現其中有著不可告人的秘密；在柯南抽絲剝繭的調查後，發現刑警因與黑道間的利益糾葛而引發了殺人動 機，並且故佈疑陣企圖誤導警方偵察的方向，柯南能揭開陰謀的內幕，查出真相嗎？
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新 名偵探柯南 VOL.9
◎舞台女演員殺人事件
◎米花之狼殺人事件
◎三胞胎別墅殺人事件
三胞胎兄弟的恩怨情仇……
園子邀科南與小蘭至家中別墅度假，卻發生了古怪的殺人事件，小蘭親眼目睹了兇手的面貌，但嫌犯竟是死者的兒子，且三人長得一模一樣，在無法辨識兇手的情況下，整個案情陷入膠著，柯南如何利用其敏銳的偵探能力，揭開謊言，解開謎底？
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新 名偵探柯南 VOL.10
◎黑夜怪男爵殺人事件（上）
◎黑夜怪男爵殺人事件（中）
◎黑夜怪男爵殺人事件（下）
黑夜的怪男爵的出現……
一件墜樓事件發生在科南、小蘭與毛利小五郎參加的旅行團下塌的旅館之中，原本懸疑的案情因黑夜怪男爵的突然出現變得更為錯綜複雜，看似單純的自殺事件卻因一套"電腦秘密程式"而牽扯出多年前的恩怨；是謀殺？復仇？還是另有原因？且看科南如何偵破這充滿離奇的案件……
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新 名偵探柯南 VOL.11
◎少年偵探團遇難事件
◎死神陣內殺人事件
◎金融公司社長殺人事件
捲入謀殺案的少年偵探團……
柯南、小蘭與少年偵探團成員一起至海邊遊玩，無意間遇到一對男女朋友，由於其男友的行徑古怪，令人感到懷疑；觀察力敏銳的科南，看出一起謀殺計畫正悄悄的進行，到底誰是兇手預定殺害的目標，少年偵探團亦被捲入謀殺案中，柯南一行人能脫離險境嗎？
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新 名偵探柯南 VOL.12
◎柯南VS怪盜基德（上）
◎柯南VS怪盜基德（下）
◎流浪畫家殺人事件
怪盜基德的挑戰……
名聞天下的怪盜基德指名要盜取某企業集團董事長的傳家之寶，並且還發出時間、地點通知函，行徑非常囂張，企業集團董事長感到非常慌張而拜託毛利小五郎偵查此案；寶物在警方重重戒備保護之下，怪盜要如何避開警方的封 鎖，下手盜取寶物？一場名偵探VS怪盜的好戲即將展開……
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新 名偵探柯南 VOL.13
◎富豪家族連續慘死事件（上）
◎富豪家族連續慘死事件（下）
◎行動電話殺人事件
神秘的復仇行動……
企業集團董事長委託毛利小五郎尋找其年輕時的初戀情人，原本單純的尋人事件，卻演變成連續二起神秘殺人事件；神出鬼沒的兇手令企業集團內成員人人自危；在毫無頭緒下，整個案情陷入膠著；柯南在辦案過程中突然發現事實的真相，原來整個命案背後是導因於一段年少輕狂，因愛生恨的陳年往事……
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新 名偵探柯南 VOL.14
◎當紅藝人綁架事件（上）
◎當紅藝人綁架事件（下）
◎綜合醫院殺人事件
樂譜中的旋律暗藏殺機……
柯南、小蘭和偵探團朋友一行人去參加知名歌星的現場演場會，在演唱會開始前兩位歌星遭到綁架，行蹤不明；科南發現歹徒所要求交贖的物品中有一張神秘的樂譜，樂譜中的歌詞竟然牽扯到一件殺人滅口的陰謀，柯南如何運用智慧解救人質，化解危機？
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新 名偵探柯南 VOL.15
◎大怪獸蛾魔拉殺人事件
◎滑雪別墅殺人事件（上）
◎滑雪別墅殺人事件（下）
令人折服的高超推理技巧……
園子和小蘭、柯南一同上山滑雪度假，恰巧在別墅中遇到以前的小學老師，入夜後的山上風雨交加，交通困難，別墅中園子和老師卻遭到兇手連續的攻擊，正當科南進行調查時，又發生了謀殺案；兇手的殺人計畫似乎繼續進行著，別墅中所有的人正陷入極端的危險之中；柯南雖然以看出兇手是誰，但心中卻有所顧忌……